La Comisión Ejecutiva Federal es el máximo órgano de dirección permanente de UPA, responsable de la actividad sindical de negociación, representación, convocatoria de manifestaciones y movilizaciones, etc. La Comisión adquirió su actual configuración en el 7º Congreso Federal de UPA, celebrado en diciembre de 2009.
Secretaría General • Lorenzo Ramos Silva
Vicesecretaría General • Montserrat Cortiñas González
Secretaría de Organización • Marcos Alarcón Alarcón
Tesorería y Secretaría de Igualdad • Teresa López López
Secretaría de Agricultura • Juan Ignacio de Antonio Senovilla
Secretaría de Ganadería • Román Santalla Agra
Secretaría de Formación y Programas • José Luis Gutiérrez García
Secretaria de Relaciones Institucionales • Domiciano Pastor Martínez
Secretaría de Relaciones Internacionales • José Manuel Roche
Secretaría Ejecutiva • Ignacio Huertas de La Peña
Secretaría Ejecutiva • Julián Morcillo Carrizo
Secretaría Ejecutiva • Mª Luisa Pérez San Gerardo
Secretaría Ejecutiva • Eusebio Fernández García
Secretaría Ejecutiva • Francisca Iglesias Galera
Secretaría Ejecutiva • Alicia Bernardo Álvarez
Secretaría Ejecutiva • Elisa Fernández López
Secretaría Ejecutiva • Ricardo Bayo Huersio
Secretaría Ejecutiva • Mª Nieves Gutiérrez Rosendo
Secretaría Ejecutiva • María Antonia Alcalá Jiménez